單方治療過敏性鼻炎效果不佳時，可應用多種組合的複方治療來處理。常見的複方療法包括口服藥加口服藥、口服藥加鼻噴劑及鼻噴劑加鼻噴劑。口服抗組織胺與口服去充血劑適合用於單方抗組織胺無法控制的過敏性鼻炎和鼻塞；口服抗組織胺與口服白三烯受體拮抗劑則不建議用於季節性過敏性鼻炎；口服抗組織胺與類固醇鼻噴劑對季節性及終年性過敏性鼻炎症狀之改善，未優於單獨使用類固醇鼻噴劑；口服白三烯受體拮抗劑與類固醇鼻噴劑合併使用則不建議；類固醇鼻噴劑與抗組織胺鼻噴劑可用於12歲以上中重度季節性過敏性鼻炎患者的初始治療或者單方治療效果不佳者；類固醇鼻噴劑與鼻內異丙托溴銨可以用於使用類固醇鼻噴劑後仍持續有鼻水症狀的過敏及非過敏性鼻炎患者；類固醇鼻噴劑與鼻內去血劑可用於單方鼻噴劑治療效果不佳者，但要小心長期使用去充血劑的副作用。鼻炎的另類療法較常見的是針灸跟中草藥，但是目前實證尚不足以支持其完全取代現有的常規治療。針灸因為沒有嚴重的不良結果，或可視為是安全的輔助療法,至於中草藥因為可能有藥物跟中草藥的相互作用或可能有毒性，因此還需要後續更多的研究來證明中草藥的功效以及其安全性。
